0403花蓮地震對當地原住民族教會也造成嚴重損壞，影響了族人心靈信仰的場域。日前由行政院鄭副院長主持「113年0403花蓮地震災後復原重建工作所需經費來源」研商會議，會中決議將花蓮縣原住民族教會的地震復原重建需求，納入賑災基金會賑助範疇，協助教會重建及修繕。
經原民會統計，花蓮縣境內有不少教會及玉山神學院建築物樑柱損壞、牆面地板嚴重坍塌等災損。原民會夷將Icyang主委特別在鄭副院長主持的會議，建議將花蓮縣原住民族教會的地震復原重建需求納入賑災基金會，這是對原住民族語言文化及心靈信仰中心重建最大的支持。
未來原民會就教會毀損調查結果，將持續盡速轉請內政部國土署協調專業評估機構，依據建物受災狀況進行判定，以利後續給予協助，原民會也將持續給予教會必要的支援。